Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Gm29125-201ENSMUST00000187121 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc183A2AJB1 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc183A2AJB1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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