Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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