Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Zbed3Q9D0L1 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Zbed3Q9D0L1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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