Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Lpin3-201ENSMUST00000040872 3458 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Palld-201ENSMUST00000034057 3566 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ddx28Q9CWT6 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ddx28Q9CWT6 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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