Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg3Q9CPX6 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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