Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp1b4Q99ME6 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms