Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Rab28Q99KL7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rab28Q99KL7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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