Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Card11Q8CIS0 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms