Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Usp27Q8CEG8 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Usp27Q8CEG8 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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