Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
4933409G03RikQ8C5U0 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms