Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccser1Q8C0C4 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccser1Q8C0C4 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ccser1Q8C0C4 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccser1Q8C0C4 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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