Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cdca8Q8BHX3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms