Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Htatsf1Q8BGC0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms