Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SnupnQ80W37 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms