Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Clec18aQ7TSQ1 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Clec18aQ7TSQ1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms