Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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