Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmeff1Q6PFE7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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