Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg9aQ68FE2 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg9aQ68FE2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms