Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-206ENSMUST00000148631 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-214ENSMUST00000188106 6462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gpr63-201ENSMUST00000038920 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1700019J19Rik-205ENSMUST00000216531 2813 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Cep95-202ENSMUST00000103068 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Sft2d1Q5SSN7 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms