Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Gm43106-201ENSMUST00000199485 637 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ankrd13cQ3UX43 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ankrd13cQ3UX43 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ankrd13cQ3UX43 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ankrd13cQ3UX43 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ankrd13cQ3UX43 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ankrd13cQ3UX43 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ankrd13cQ3UX43 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ankrd13cQ3UX43 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Ankrd13cQ3UX43 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ankrd13cQ3UX43 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 553.8 ms