Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
E130208F15RikQ3UPV3 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms