Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm15793-201ENSMUST00000121857 495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Arhgef40Q3UPH7 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Arhgef40Q3UPH7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Arhgef40Q3UPH7 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms