Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms