Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Usp19Q3UJD6 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Usp19Q3UJD6 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Usp19Q3UJD6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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