Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Srsf6Q3TWW8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm23432-201ENSMUST00000157181 131 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Shf-205ENSMUST00000121237 882 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm17799-201ENSMUST00000183270 667 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 AC122824.1-201ENSMUST00000221705 828 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Srsf6Q3TWW8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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