Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Atp2b3Q0VF55 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Atp2b3Q0VF55 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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