Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms