Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Siah1bQ06985 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms