Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
GscQ02591 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm37759-201ENSMUST00000194155 3246 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GscQ02591 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GscQ02591 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms