Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Chn2-209ENSMUST00000146114 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm3898-201ENSMUST00000180221 613 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Tcl1b1-202ENSMUST00000222342 664 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gja5Q01231 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gja5Q01231 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms