Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Grin2cQ01098 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms