Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smyd1P97443 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smyd1P97443 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smyd1P97443 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smyd1P97443 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms