Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

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Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RptnP97347 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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RptnP97347 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RptnP97347 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RptnP97347 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RptnP97347 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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RptnP97347 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RptnP97347 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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