Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Hoxd13P70217 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Hoxd13P70217 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxd13P70217 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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