Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
SbdsP70122 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
SbdsP70122 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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