Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Slc4a2-203ENSMUST00000115049 3924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gmeb2-201ENSMUST00000049032 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gfpt1-201ENSMUST00000032057 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 4933427I04Rik-201ENSMUST00000097896 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Mef2a-208ENSMUST00000156690 5538 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cbx3-203ENSMUST00000114445 1585 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Oasl2-201ENSMUST00000031542 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gbp6-201ENSMUST00000196520 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Odf2-210ENSMUST00000113765 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm2447-202ENSMUST00000193813 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Aldh2-201ENSMUST00000031411 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Lrp1b-207ENSMUST00000142688 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm44541-201ENSMUST00000207837 2907 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Fabp12-201ENSMUST00000029043 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tnfsf15-201ENSMUST00000062246 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Eif2d-201ENSMUST00000068791 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Sem1P60897 Plec-207ENSMUST00000076442 15439 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm43764-201ENSMUST00000202553 3172 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Meis1-201ENSMUST00000068264 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm10824-201ENSMUST00000220000 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cat-201ENSMUST00000028610 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Ap3s2-201ENSMUST00000075657 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sem1P60897 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sem1P60897 B3gat1-205ENSMUST00000161115 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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