Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Irf5P56477 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irf5P56477 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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