Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm37567-201ENSMUST00000193241 2279 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rgs12-204ENSMUST00000114281 3439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms