Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Tmod1P49813 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Tmod1P49813 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms