Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxc11P31313 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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