Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Cd28P31041 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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