Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Cdca8-201ENSMUST00000030690 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sectm1a-201ENSMUST00000026162 1692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ighv2-2-201ENSMUST00000103443 352 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Vegfa-204ENSMUST00000113520 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ccdc153-206ENSMUST00000216632 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 AC124400.2-201ENSMUST00000224939 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Olfr1057-201ENSMUST00000099892 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Olfr371-202ENSMUST00000218663 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm7664-201ENSMUST00000221988 745 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gabarap-202ENSMUST00000108592 750 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 1700010K24Rik-201ENSMUST00000125852 226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pard3bos3-201ENSMUST00000147177 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm3687-201ENSMUST00000161710 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm6467-201ENSMUST00000171547 609 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Lysmd4-203ENSMUST00000207757 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm35501-201ENSMUST00000213492 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 AC159899.1-201ENSMUST00000214024 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 H2al1m-201ENSMUST00000073949 535 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprmP28828 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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