Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Tsta3P23591 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Tsta3P23591 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms