Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Itpr1-201ENSMUST00000032192 9870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sh3rf1-202ENSMUST00000209611 4416 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Akt2-204ENSMUST00000108343 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fam53b-202ENSMUST00000097998 4341 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms