Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm28048F7BCN0 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm28048F7BCN0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms