Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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PtprfA2A8L5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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