Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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