Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm43660-201ENSMUST00000200956 6548 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Wdr61Q9ERF3 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms