Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Smg9Q9DB90 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smg9Q9DB90 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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