Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44067-201ENSMUST00000203350 2971 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Apex2-205ENSMUST00000112725 3613 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal1-201ENSMUST00000010195 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9992-201ENSMUST00000070059 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14612-201ENSMUST00000121522 881 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7696-201ENSMUST00000174727 907 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gtf3c6Q9D8P7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms